Dondurarak kurutucular başlangıçta çözücü olarak su ile kullanılmak üzere tasarlanmıştı. Ortaya çıkan yeni uygulamalarla birlikte, suda çözünmeyen ürünler kimya uygulamalarında giderek daha fazla yer almaktadır. Sonuç olarak, dondurarak kurutma, su yerine organik çözücülerle kombinasyon halinde giderek daha fazla kullanılmaktadır. Organik çözücüler ve inorganik asitler ve bazlar, numunenin liyofilizasyonundan önceki araştırma ve geliştirmelerde sıklıkla kullanılmaktadır. Bu yeni tip numunelerin dondurarak kurutma sırasındaki davranışı bu nedenle işlemden önce dikkate alınmalıdır.
